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| RUNX2 | Q13950 | LSM1P1-201 | ENST00000438629 | 273 nt | BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007099.2-201 | ENST00000444852 | 336 nt | TSL 5 BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC002381.1-201 | ENST00000447049 | 280 nt | BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NUTF2P3-201 | ENST00000448540 | 384 nt | BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL163192.1-201 | ENST00000448858 | 708 nt | TSL 5 BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL36AP33-201 | ENST00000450395 | 310 nt | BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AC113192.5-201 | ENST00000528779 | 486 nt | TSL 2 BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AP002373.1-201 | ENST00000544347 | 729 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AP005380.1-201 | ENST00000584896 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GALNT1-205 | ENST00000591081 | 1120 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC024603.1-201 | ENST00000597938 | 592 nt | TSL 4 BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000403.1-201 | ENST00000603349 | 851 nt | BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGHV3-29-201 | ENST00000604817 | 344 nt | BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BCRP9-201 | ENST00000605312 | 388 nt | BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL390208.1-201 | ENST00000605885 | 644 nt | BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AC083809.1-201 | ENST00000615051 | 472 nt | BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNX18P1Y-201 | ENST00000616231 | 511 nt | BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL357080.1-201 | ENST00000617394 | 239 nt | BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U73479.1-201 | ENST00000618062 | 168 nt | BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR6830-201 | ENST00000636015 | 70 nt | BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SENP7-202 | ENST00000348610 | 3272 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TAF7L-201 | ENST00000324762 | 2107 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF117-203 | ENST00000610793 | 1374 nt | TSL 2 BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCDH15-234 | ENST00000622048 | 6820 nt | TSL 5 BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GPR34-201 | ENST00000378138 | 1815 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | WHAMMP2-201 | ENST00000512149 | 5482 nt | TSL 5 BASIC | 3.98 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EFHC1-205 | ENST00000538167 | 5308 nt | TSL 5 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RANBP2-201 | ENST00000283195 | 11711 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C8orf34-203 | ENST00000348340 | 3571 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C12orf45-204 | ENST00000552951 | 23529 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ITCH-202 | ENST00000374864 | 6401 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCN3A-209 | ENST00000639244 | 8854 nt | TSL 5 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC021355.1-202 | ENST00000519996 | 1633 nt | TSL 2 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ECT2-204 | ENST00000392692 | 4158 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-989P-201 | ENST00000362756 | 107 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.201-201 | ENST00000364052 | 96 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRIM2-202 | ENST00000370687 | 909 nt | TSL 3 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | WFDC6-202 | ENST00000372670 | 620 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL031679.1-201 | ENST00000400616 | 525 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP48-201 | ENST00000406913 | 488 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP266-201 | ENST00000410232 | 287 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAGI2-AS2-201 | ENST00000411616 | 476 nt | TSL 2 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FGF12-AS1-201 | ENST00000414920 | 580 nt | TSL 4 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FRMPD3-AS1-201 | ENST00000415252 | 457 nt | TSL 3 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EIF1AX-AS1-201 | ENST00000424026 | 378 nt | TSL 5 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590233.1-201 | ENST00000430017 | 456 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL365184.2-201 | ENST00000431139 | 435 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092839.1-201 | ENST00000433475 | 536 nt | TSL 4 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091390.1-201 | ENST00000433904 | 331 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNRPEP7-201 | ENST00000438350 | 220 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC019330.1-202 | ENST00000440609 | 504 nt | TSL 4 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL121957.1-201 | ENST00000441532 | 338 nt | TSL 2 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO2P18-201 | ENST00000457151 | 658 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | snoU109.4-201 | ENST00000458953 | 143 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS26P28-201 | ENST00000470806 | 348 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATP5J2-209 | ENST00000488775 | 306 nt | TSL 2 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC082651.2-201 | ENST00000496833 | 166 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL139147.1-201 | ENST00000502413 | 1156 nt | TSL 2 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093864.1-201 | ENST00000504555 | 745 nt | TSL 5 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCOC-206 | ENST00000506322 | 687 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IL7R-204 | ENST00000506850 | 1004 nt | TSL 2 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC024587.2-201 | ENST00000509458 | 805 nt | TSL 3 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VWA8P1-201 | ENST00000510889 | 176 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02149-201 | ENST00000511443 | 558 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EGFLAM-AS2-201 | ENST00000512603 | 466 nt | TSL 5 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008780.1-201 | ENST00000513392 | 409 nt | TSL 5 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093853.1-201 | ENST00000515689 | 483 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLIT2-IT1-201 | ENST00000515882 | 601 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL12P22-201 | ENST00000519073 | 490 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090796.1-201 | ENST00000520370 | 567 nt | TSL 4 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP005357.1-201 | ENST00000520749 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009597.1-201 | ENST00000521215 | 584 nt | TSL 4 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003730.1-201 | ENST00000524605 | 285 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC105233.3-201 | ENST00000531125 | 744 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SAMD15-202 | ENST00000533095 | 412 nt | TSL 5 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SOX9-AS1-214 | ENST00000540802 | 578 nt | TSL 4 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359233.1-201 | ENST00000554029 | 364 nt | TSL 3 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02126-202 | ENST00000563754 | 750 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCYBP33-201 | ENST00000575007 | 1130 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |