Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX2Q13950 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms