Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms