Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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TCIRG1Q13488 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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TCIRG1Q13488 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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TCIRG1Q13488 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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TCIRG1Q13488 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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TCIRG1Q13488 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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