Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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