Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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CALCOCO2Q13137 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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CALCOCO2Q13137 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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CALCOCO2Q13137 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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