Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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