Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
GRIK3Q13003 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK3Q13003 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms