Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms