Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms