Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CENPEQ02224 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CENPEQ02224 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms