Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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