Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM35Q9UPQ4 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM35Q9UPQ4 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
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