Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms