Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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GOPCQ9HD26 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GOPCQ9HD26 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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