Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms