Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD42Q8N9B4 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms