Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CCDC93Q567U6 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CCDC93Q567U6 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CCDC93Q567U6 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CCDC93Q567U6 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CCDC93Q567U6 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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