Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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ZNF239Q16600 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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