Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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