Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms