Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms