Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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