Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNCBQ16143 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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