Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SS18Q15532 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SS18Q15532 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SS18Q15532 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SS18Q15532 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SS18Q15532 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SS18Q15532 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SS18Q15532 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms