Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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