Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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