Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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NKX1-1Q15270 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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NKX1-1Q15270 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NKX1-1Q15270 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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