Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms