Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms