Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SMC1AQ14683 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms