Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP140Q13342 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms