Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SKP2Q13309 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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SKP2Q13309 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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