Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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