Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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PTPN13Q12923 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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PTPN13Q12923 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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PTPN13Q12923 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPN13Q12923 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPN13Q12923 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPN13Q12923 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPN13Q12923 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN13Q12923 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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