Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms