Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms