Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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PTPRBP23467 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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PTPRBP23467 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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