Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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