Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GGA3Q9NZ52 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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