Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SLC10A4Q96EP9 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms