Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 EIF3IP1-201ENST00000433048 967 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RN7SL302P-201ENST00000475999 300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RN7SL107P-201ENST00000478127 283 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RAB2A-208ENST00000529579 680 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ULK4P3-202ENST00000565158 593 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC024270.3-201ENST00000565513 396 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.123-201ENST00000616695 286 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 U3.34-201ENST00000408198 212 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CCNT2-AS1-203ENST00000428857 677 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MRLN-202ENST00000430431 495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms