Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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SGCAQ16586 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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SGCAQ16586 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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SGCAQ16586 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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SGCAQ16586 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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SGCAQ16586 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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SGCAQ16586 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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SGCAQ16586 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCAQ16586 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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