Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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RPE65Q16518 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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RPE65Q16518 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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RPE65Q16518 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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RPE65Q16518 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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RPE65Q16518 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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RPE65Q16518 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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