Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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