Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.6 ms