Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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