Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERPUD1Q15011 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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