Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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GPNMBQ14956 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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GPNMBQ14956 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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GPNMBQ14956 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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GPNMBQ14956 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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GPNMBQ14956 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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GPNMBQ14956 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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GPNMBQ14956 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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GPNMBQ14956 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPNMBQ14956 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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