Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL9A3Q14050 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms