Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CNGB1Q14028 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms